Terminados los trabajos del Convento de San Agustín en 1580, la plaza fue bautizada con el mismo nombre del convento. Para el año de 1828 el gobierno del general Francisco de Paula Santander dispuso que en dicho edificio se instalara la Universidad del Istmo y Magdalena, e inmediatamente el lugar fue llamado "Plaza de la Universidad". Luego, el Consejo Municipal dispuso que el sitio se llamara "Plaza de los Estudiantes".